名侦探柯南密室逃脱游戏继承了《CUBIC ROOM》系列的玩法，故事剧情为本作原创，走得是《名侦探柯南》系列少见的温馨路线，内容整体则由序章与连贯的 4 个场景组成。玩家在游戏中就将扮演和柯南、小兰与小五郎一行人，发挥机智与巧思以突破场景中的谜题。游戏中的 4 个场景是连贯的，但玩家仍可由章节选单直接选择场景。本作的界面相当类似於《CUBICROOM》，同样有着精致的场景与物件，操作方式也很相近。玩家进入关卡之後，会身处於一个四面方形的房间，在画面上左右拖曳即可环视房间的各个方向，当玩家发现有任何可疑的地方，轻触该处（若是有对应）画面便会放大显示，而要离开特写的部份，只需用手指「由上往下」拖曳，画面就会恢复为一般的状态。画面相当精细，各种谜题的难度也尚算合理。游戏中，玩家将会拿到各种小道具，该如何运用这些道具就是过关的关键。当玩家捡到一项物品，该物会以图示的形式列於画面的下方，点击图示使物品图示亮起，就表示正在使用这项物品的意思，当然玩家也可以点选不同物品加以组合。在这边偷偷给玩家们一点提示，就是本作中常有同样的一个物品以不同方式多次重复使用的情况，真的卡关时，不妨从手上的物品能有什麽样不同的利用方法为方向思索。组合各种道具，将物品物尽其用将是破关的重要关键游戏谜题本身难度并不算太高，大部分都是运用常识或是非常一般的物理原理即可破解，比较困难的地方反倒是要找出解谜所需要的各种物品。解谜时，点选同一个特写画面的不同位置（例如底部或是柜子），有机会以不同的方向查看物体或是打开机关，许多重要物品都是藏在类似此种非常不起眼的角落里，玩家可以多多注意。若是真的左思右想想破头也无法解开的情况，游戏中也有贩售「提示」，一次 200 日圆，购买後柯南便会现身指引玩家。

本作的界面相当类似於《CUBICROOM》，同样有着精致的场景与物件，操作方式也很相近。

画面相当精细，各种谜题的难度也尚算合理。

点选同一个特写画面的不同位置，有机会以不同的方向查看物体或是打开机关。