女装创世记是一款日系风格的恋爱养成类手游，伪娘的新世界到来了！女装系列的10年的历史的一切，于此集大成。人与神，男人与伪娘，然后祝福所有人类的全新的创世的神话，即将开始！指引玩家的精神到极为高深的层次，导引至全新世界的宝典，终于降临。

由于环和昴所引起的和伪娘的恋爱禁止骚动也告一段落，取回平静生活的主人翁们。原本要努力准备大祭，但是得知废材神的绯和的实体，竟然是从太古时代就存在的强大的混沌之神！在混沌的黑暗即将把世界的一切都吞没的时候，伪娘们从绝望的深渊站起来了。究竟奇迹会发生吗？男人和伪娘之间的恋爱的未来结局是！？神社三部作，于此堂堂完结。

绯和（ひのわ）

混沌的女装女神

她以其强大的力量将主人翁玩弄于手心，她的真意是……

圆藤美代（えんどうみしろ）　

女装姐姐巫女
执着心很强病娇化的爱过剩的伪娘的姐姐。
虽然和结反目成仇但之后和解。现在双方互相认同是雅人的妻子。

结（ゆい）

被封印于神社的女装女神

若过度使用神的力量，就会变成小孩子的姿态。

高藤昴（たかとうすばる） 　

管教严谨的伪娘巫女
过去被美代赶出去的前代的巫女长。
虽然当初是对于男人和伪娘的恋爱绝不认可，现在和主人翁陷入
爱河，采取协力的态度。
和美代是水火不相容，争夺正妻宝座的对手关系。

对于和男人的恋爱采否定态度的女装女神
结的妹妹的女装女神。别名是别玉非女神命（ことたまひめがみのみこと）
想要再度封印复活了的结，而降临于地上俗世，为了掌握神社的主导权而协助昴，
但是在和主人翁陷入爱河之后改变态度。

雅人（まさと）
本作品的主人翁
别结神社的神主，本作品的主人翁。
虽然继结以及美代之后，也和和昴、环成为恋人，但是在享受和伪娘之间的恋爱前，被迫面临由绯和所引起的世界崩坏的危机。
究竟他的运命会如何！？