口袋妖怪绿宝石386是一款由官方制作的带有冒险元素的卡通游戏。在本作中关于“口袋妖怪”未来世界的章节将逐渐明了，将是个涉及大地和海洋的壮大的故事。主人公在游戏中必须要去阻止在“红宝石/蓝宝石”中出现的两大势力的阴谋。游戏中将加入可以游玩7大战斗的“BATTLE FRONTIER”。其中包括靠战斗来一决胜负的“BATTLE DOOM”，玩家将靠3匹口袋妖怪进行连战；还有靠运气的“BATTLE TUBE”，是从3个入口中选择其一，最终目标是到达终点的充满挑战的设施。
口袋妖怪绿宝石386是以RPG冒险元素为主要内容的一款模拟器游戏，游戏中未来世界的章节逐渐明了，涉及了大地和海洋的壮大故事。全新的故事线融合了Magma队和Aqua队两条主线，还有七个战斗主题公园的全新情节。
双打对战
在红蓝宝石版中，进行双打对战的训练家是并排站立的。在绿宝石版的冒险过程中，在不同位置站立的两个训练家如果同时发现主角，同样会开始双打对战。其中不乏躲在暗处的训练家。
战斗动画
| 在绿宝石中，当宝可梦自草丛中出现和飞出宝可梦球的时候，会有表情丰富的动作。有强有力的呐喊，有心情舒畅的振翅。每个宝可梦的动作都不同 |
神奇领航
| 在红蓝宝石版就有登场的宝可梦领航员可以查看地图，确认宝可梦的状态等。在绿宝石中，宝可梦领航员加入了呼叫功能。在领航员上登录的人物可以进行远距离呼叫 |
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